Μια ομάδα επιστημόνων με επικεφαλής το Ινστιτούτο Wellcome Sanger ανέπτυξε τον πιο λεπτομερή κυτταρικό χάρτη του ανθρώπινου εντέρου μέχρι σήμερα, συνδυάζοντας δεδομένα από 1,6 εκατομμύρια κύτταρα.
Ο χάρτης αυτός παρέχει κρίσιμες γνώσεις για τον καρκίνο του εντέρου και τη φλεγμονώδη νόσο του εντέρου (IBD), επισημαίνοντας τις κυτταρικές αλλαγές και αλληλεπιδράσεις εντός του γαστρεντερικού σωλήνα (GI). Η μελέτη αυτή δημοσιεύτηκε στο περιοδικό Nature και προέκυψε μετά από συνδυασμό 25 συνόλων δεδομένων ενός κυττάρου. Το αποτέλεσμα είναι η δημιουργία ενός ενοποιημένου και ελεύθερα διαθέσιμου πόρου για ερευνητές σε όλο τον κόσμο. Ο χάρτης αυτός περιλαμβάνει δείγματα τόσο από υγιή άτομα όσο και από άτομα με ασθένειες που σχετίζονται με το έντερο.
Η ομάδα του Ινστιτούτου Wellcome Sanger ανέπτυξε ένα εργαλείο για την εναρμόνιση των συνόλων δεδομένων, επιτρέποντας στους ερευνητές να δουν μια ενοποιημένη εικόνα των κυττάρων του εντέρου, τις τοποθεσίες τους και τις αλληλεπιδράσεις τους. Οι ερευνητές συγχώνευσαν τα σύνολα αυτά δεδομένων σε ένα ενοποιημένο πόρο που περιέχει χωρικά και μονοκύτταρα δεδομένα από 1,6 εκατομμύρια κελιά. Ο πόρος αυτός επιτρέπει στους ερευνητές να προσδιορίσουν ποια κύτταρα υπάρχουν στο έντερο, τις ακριβείς τους θέσεις και πώς επικοινωνούν με το περιβάλλον τους. Με τον τρόπο αυτό, έχει δημιουργηθεί ένα δυναμικό μέσο το οποίο μπορεί να ενημερωθεί με μελλοντικές μελέτες, ενισχύοντας τη συνεργασία μεταξύ επιστημόνων σε όλο τον κόσμο.
Η γαστρεντερική οδός περιλαμβάνει όργανα υπεύθυνα για την πέψη και την απορρόφηση θρεπτικών συστατικών και λειτουργεί ως φράγμα ενάντια στα παθογόνα. Διαταραχές που επηρεάζουν αυτό το σύστημα, όπως η IBD και ο καρκίνος του εντέρου, επηρεάζουν σημαντικά εκατομμύρια ανθρώπους παγκοσμίως. Ο καρκίνος του εντέρου αποτελεί έναν από τους πιο συχνούς καρκίνους παγκοσμίως.
Ένα από τα σημαντικά ευρήματα της μελέτης αφορά τα μεταπλαστικά κύτταρα του εντέρου, τα οποία είναι κύτταρα που βρέθηκαν να μοιράζονται γενετικές ομοιότητες με φλεγμονώδη κύτταρα στο έντερο. Οι ερευνητές προτείνουν ότι σε καταστάσεις όπως η IBD, η φλεγμονή μετασχηματίζει αυτά τα μεταπλαστικά κύτταρα, διαιωνίζοντας τον κύκλο της φλεγμονής. Η κατανόηση αυτού του κύκλου φλεγμονής θα μπορούσε να οδηγήσει σε καινοτόμες θεραπείες για το IBD και παρόμοιες χρόνιες παθήσεις.
Βρέθηκε θαμμένος θησαυρός γεμάτος χρυσό και εξωγήινο μέταλλο!
Η έρευνα αυτή αποτελεί μέρος της πρωτοβουλίας Human Cell Atlas (HCA), η οποία στοχεύει στη χαρτογράφηση κάθε τύπου κυττάρων στο ανθρώπινο σώμα για την καλύτερη κατανόηση της ανθρώπινης υγείας και ασθένειας. Ο Άτλας των Εντερικών Κυττάρων αντιπροσωπεύει ένα σημαντικό άλμα στην κυτταρική βιολογία και την ανάπτυξη νέων αναλυτικών εργαλείων.
